Une fois construits et en exploitation, les autoroutes et autres équipements de transport (tels que les terminaux) ont des effets durables sur la qualité des eaux avoisinantes et de l'hydrologie locale. Ce sont des vecteurs constants de sédiments et de produits contaminateurs résultant de l'écoulement des matériaux déposés à la surface de la route par la circulation et les équipes d'entretien des routes, et par l'érosion des accotements et la dégradation des matériaux de construction. Les écoulements s'infil trent dans les nappes phréatiques en se déversant directement dans des étangs adjacents et d'autres eaux de surface, par les systèmes de drainage, et par l'infiltration des eaux de surface. La migration du salage des routes dans les réservoirs publics et les puits privés constitue un problème important. La trace physique que laisse le système de transport a également de profondes répercussions: les cours d'eau sont déviés et les marais remplis, ce qui empêche le mouvements d'eau et modifie l'emplacement des réseaux de cours d'eau et de drainage.